聚對苯二甲酸乙二醇酯(PET)是目前全球應用最廣泛的合成聚酯,被廣泛用于飲料、食品包裝材料以及紡織纖維。然而,其廢棄物不可自然降解,導致了較嚴重的環(huán)境污染。利用環(huán)境友好的生物法將廢棄塑料降解為較低分子量單體,進行循環(huán)利用,能顯著促進節(jié)能減排,助力碳中和目標的實現(xiàn)。
中國科學院天津工業(yè)生物技術研究所結(jié)構(gòu)生物學平臺實驗室和德國格拉夫斯瓦爾德大學合作,對來源于宏基因組的兩種塑料水解酶(PES-H1和PES-H2)進行了研究,解析了其高分辨結(jié)構(gòu)以及與PET類似物的復合物結(jié)構(gòu)。并通過結(jié)構(gòu)分析和分子動力學模擬探究了產(chǎn)抑制和多重底物結(jié)合模式,為進一步推進PET的綠色降解提供了重要支撐。
目前,PDB數(shù)據(jù)庫中已有超過70種PET降解酶的晶體結(jié)構(gòu),但大多數(shù)是沒有底物結(jié)合的apo結(jié)構(gòu)。為研究PET水解的催化機理,研究團隊分別解析了PES-H1與檸檬酸鹽(PDB:7E30)以及與底物類似物MHETA的(PDB:7W6C,7W6O和7W6Q)復合體結(jié)構(gòu),以更好地理解結(jié)合PET底物時蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的變化。此外,還解析了PES-H2與聚乙二醇(PEG)6000(PDB:7E31)和與BHET(PDB:7W66)復合體結(jié)構(gòu)。根據(jù)PES-H1(結(jié)合MHETA)和PES-H2(結(jié)合BHET)的結(jié)構(gòu),確定了6種配體結(jié)合模式,揭示了多種非催化中間體結(jié)合模式,以此為基礎,對潛在的熱點基因和底物結(jié)合區(qū)的關鍵位點進行了探究。結(jié)果表明,PES-H1-R204C/S250C變體的Tm比野生型酶提高了6°C以上;在72°C下,PES-H1-L92F/Q94Y變體不但提高了對非晶態(tài)PET膜和預處理的真實PET廢物的水解活性,而且水解低結(jié)晶度PET的效率是此前文獻報道活性最高的LCC-ICCG的兩倍多,這一工程突變體有望成為工業(yè)塑料回收過程中的降解酶。
上述研究得到了國家重點研發(fā)計劃、天津市合成生物技術創(chuàng)新能力提升行動、中國科學院青年創(chuàng)新促進協(xié)會和國家留學基金管理委員會的資助。天津工業(yè)生物所劉衛(wèi)東研究員和德國格拉夫斯瓦爾德大學韋韌以及Uwe T. Bornscheuer教授為共同通訊作者。
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PES-H1和PES-H2的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)
PES-H1突變體對多種PET材料的水解活性